奥林巴斯显微镜根据用途以及应用范围分为金相显微镜、生物显微镜、体视显微镜等。
奥林巴斯金相显微镜主要是用来鉴定和分析金属内部结构组织，是金属学研究金相的重要仪器，是工业部门鉴定产品质量的关键设备，专门用于观察金属和矿物等不透明物体金相组织的显微镜。这些不透明物体无法在普通的透射光显微镜中观察，故金相和普通显微镜的主要差别在于前者以反射光，而后者以透射光照明。
不仅可以鉴别和分析各种金属、合金材料、非金属物质的组织结构及集成电路、微颗粒、线材、纤维、表面喷涂等的一些表面状况，金相显微镜还可以广泛地应用于电子、化工和仪器仪表行业观察不透明的物质和透明的物质。如金属、陶瓷、集成电路、电子芯片、印刷电路板、液晶板、薄膜、粉末、碳粉、线材、纤维、镀涂层以及其它非金属材在金相显微镜中照明光束从物镜方向射到被观察物体表面，被物面反射后再返回物镜成像。所以用奥林巴斯金相显微镜来检验分析金属内部的组织结构在工业生产中是十分重要的。
奥林巴斯生物显微镜是最常见的一种显微镜，在很多实验室中都可以见到，主要是用来观察生物切片、生物细胞、细菌以及活体组织培养、流质沉淀等的观察和研究，同时可以观察其他透明或者半透明物体以及粉末、细小颗粒等物体。奥林巴斯生物显微镜供医疗卫生单位、高等院校、研究所用于微生物、细胞、细菌、组织培养、悬浮体、沉淀物等的观察，可连续观察细胞、细菌等在培养液中繁殖分裂的过程等。在细胞学、寄生虫学、肿瘤学、免疫学、遗传工程学、工业微生物学、植物学等领域中应用广泛。
奥林巴斯体视显微镜又称为实体显微镜、立体显微镜，是一种具有正像立体感的目视仪器，广泛的应用于生物学、医学、农林等。它具有两个完整的光路，所以观察时物体呈现立体感。奥林巴斯体视显微镜的主要用途有：作为动物学、植物学、昆虫学、组织学、考古学等的研究和解剖工具。对各种材料气孔形状腐蚀情况等表面现象的检查。做纺织工业中原料及棉毛织物的检验。在电子工业，做晶体等装配工具。对文书纸币的真假判断。透镜、棱镜或其它透明物质的表面质量，以及精密刻度的质量检查等。
奥林巴斯显微镜常用的五种观察方法
一、暗视野法
观察试样干涉及衍射光的方法。照明光线通过物镜外围斜射于试样，来自试样的干涉及衍射光即被观察到。适用检测试样上微细的擦痕或裂痕、检测晶片等试样镜状表面。
二、明视野法
观察试样直接反射光的方法。照明灯的光通过物镜垂直导向而入射于试样，来自试样的直接反射光通过物镜即被观察到。
三、偏振光法
这是使用由两个一组的滤色镜(检偏振器和起偏振器)形成偏光的显微观察技术。这些偏光轴始终保持相互垂直。一些试样在两个滤色镜之间呈鲜明的对比。或根据双折射性能和定向(即、锌结构的抛光试样)呈现颜色。在检偏振器插在目镜前的观察光路时，起偏振器位于垂直照明前面的光路。
适合观察金相结构(即、球墨铸铁的石墨增长形态)，矿物和液晶(LCD)以及半导体材料。
四、荧光法
本技术用于发出荧光的试样。适合利用荧光法检测晶片的污染，感光性树脂的残留物，以及检测裂缝。
五、微分干涉对比法
这是将用明视野法可能观察不到的试样高度微小差异通过改善对比法变为立体或三维图像的显微观察技术。照明光由微分干涉对比棱镜变为两束衍射光。这两束衍射光使试样高度差异造成在光路上的微小差异，而光路差异变为利用微分干涉对比棱镜和检偏振器的明暗对比。再利用敏感色板，加强了高度差异的颜色变化。
适合检测包括金相结构、矿物、磁头、硬磁盘表面和晶片精制表面等有极其微细高度差异的试样。
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